Thomson Lyra -> HDD formatieren?

Ich hab folgendes Problem mit meiner Thomson Lyra Jukebox (MP3 Player mit Harddisk)
Einige MP3 Dateien auf der HDD kann ich weder lesen noch löschen. Das Ding funktioniert zwar wie eine externe Festplatte, der Explorer gibt mir aber immer die Meldung ich solle doch Checkdisk durchführen, da einige Dateien defekt sind.
Meine Frage, wenn ich die Systemdateien der Jukebox auf meinen Rechner kopiere, dann die HDD der Jukebox formatiere, kann dann noch drauf zugreifen, und diese Files einfach zurückkopieren? Wäre mein Problem dann damit gelöst? Oder gibt es irgendein Utility, mit dem man solche externen HDDs checken und fixen kann?

lg. BootyCat