[HELP]PHP,SH + dir produziert Unfug

Hiho.
Bräuchte hier mal kurz Hilfe bitte :-/
Folgendes Problem, ich hab den PHP code :

Code:

$myFile = "neu.sh";
$fh = fopen($myFile, 'w') or die("can't open file");
$stringData = "cd \ncd Desktop/blast-2.2.21/bin/\n";
fwrite($fh, $stringData);
$stringData = "./blastall -p blastn -d swissprot -i testFile.txt -o outpur.text \n ";
fwrite($fh, $stringData);
fclose($fh);

exec("sh /Library/WebServer/Documents/neu.sh",$results);

Damit entsteht mir ein "neu.sh" File mit dem Inhalt:
cd
cd Desktop/blast-2.2.21/bin/
./blastall -p blastn -d swissprot -i testFile.txt -o outpur.text

Wenn ich es mit dem Form ausführe, dann schreibt er mir die "outpur.text" Datei die das Argument ist, für den output aber in den lokalen Folder(Apache Ordner), wenn ich das .sh File mit dem Terminal aufmach haut aber alles hin und es kommt in den Desktop Ordner ? Woran kann das liegen :-/

sh_exec hat keine Besserung gebracht, das hatte ich schon, Rechte sollten die gleichen bei beiden Ordnern sein (chmod 755).

Danke schonmal

Wenn PHP als Apache-Modul läuft, dann ist das so. Eine Alternative wäre PHP als CGI + suexec.

Zitat von mat

Wenn PHP als Apache-Modul läuft, dann ist das so. Eine Alternative wäre PHP als CGI + suexec.

Eine weitere Alternative ist das Apache MPM "ITK": http://mpm-itk.sesse.net/